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磁珠法核酸提取常見問題的原因分析及解決辦法

時間:2022-05-18 09:48:35 來源:洛陽慧慶生物科技有限公司
  磁珠法核酸提取常見問題的原因分析及解決辦法:


  問題1、磁珠殘留

  原因:(1)磁珠:粒徑小、表面基團松散磁含量低;(2)設備:磁分離方式、磁場弱;(3)操作:參數(shù)設置不合適。
  解決辦法:(1)篩選、替換匹配的磁珠; (2)更換磁珠;(3)放慢磁介入速度并延長吸附時間。


  問題2、磁珠結塊

  原因:(1)微球吸附過多雜質(蛋白、脂質、多糖); (2)微球粒徑太?。?3)洗滌完畢,乙醇干燥時間過長。
  解決辦法:(1)優(yōu)化裂解液結合液配方; (2)選擇粒徑較大的微球;(3)縮短干燥時間。


  問題3、純度差

  原因:(1)裂解不充分; (2)微球分散性不好; (3)微球吸附能力太強。
  解決辦法:(1)優(yōu)化試劑裂解液配方; (2)篩選合適粒徑及表面的磁珠;(3)磁珠表面鈍化處理。


  問題4、得率低

  原因:(1)磁珠吸附能力較弱; (2)磁珠洗脫效率較弱;(3)提取試劑(pH、鹽、醇)與磁珠不匹配。
  解決辦法:(1)改變表面基團種類及密度;(2)減少干燥時間、加熱洗脫;(3)優(yōu)化試劑配方。


  關鍵因子及對提取的影響

  在進行核酸提取或純化時,必須密切注意一些因素,如pH值、鹽濃度、溫度、緩沖體積和潛在的乙醇污染。這些因素中的每一個都會極大地影響下游實驗的得率、質量和成功率。
  1.非最適pH值或鹽濃度可改變核酸的電荷,導致核酸不能與離心柱結合,或導致苯酚/氯仿錯誤的溶解核酸。
  2.緩沖液體積不正確,可導致不完全裂解,中和或間接稀釋洗脫的核酸。
  3.乙醇污染可以抑制下游的酶反應,并使樣品從瓊脂糖凝膠中飄浮出來。
  磁珠法核酸提取可以簡單、快速、高效地實現(xiàn)多種類型樣本的核酸提取;不僅可以節(jié)省時間,還可以減少手工操作引起的失誤,提高每次實驗結果的可重復性及均一性。

  

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